O AMJP disponibiliza atividades de carácter experimental e pedagógico, dirigidas a diferentes públicos. Partilhando conhecimentos, fomentando o contacto com a arte e incentivando os visitantes a assumir uma postura crítica, o AMJP desenvolve atividades regulares para escolas, universidades e grupos organizados e acolhe propostas para projetos que tenham por base o seu acervo. Tem ainda uma programação de fim de semana que engloba visitas temáticas para público geral com interpretação em Língua Gestual Portuguesa e oficinas para crianças e famílias.